Анализ полиморфизма 185delAG гена BRCA1 у больных онкопатологией в Кабардино-Балкарии

NovaInfo 132, с.11-13, скачать PDF
Опубликовано
Раздел: Биологические науки
Просмотров за месяц: 7
CC BY-NC

Аннотация

Цель работы заключалась в поиске и оценке частоты мутации 185delAG в гене BRCA1 у больных раком молочной железы, проживающих на территории Кабардино-Балкарской Республики. Поиск мутации проводился методом полимеразной цепной реакции синтеза ДНК с последующей электрофоретической детекцией продуктов реакции. В результате скрининга мутация 185delAG в гене BRCA1 обнаружена с частотой 24,23%.

Ключевые слова

РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ, МУТАЦИЯ, ГЕН BRCA1

Текст научной работы

Геном клетки постоянно подвергается воздействию внешних и внутренних факторов, приводящих к повреждениям ДНК. Каскады клеточных событий (репарация ДНК, остановка клеточного цикла, апоптоз) важны для устранения повреждений ДНК, предотвращения неконтролируемого деления клеток и передачи нерепарируемых повреждений ДНК дочерним клеткам [1]. Люди с мутациями в генах, участвующих в этих путях более чувствительны к воздействию повреждающих агентов, подвержены более высокому риску развития рака по сравнению с нормальной популяцией [2].

При мутации или утрате гена BRCA1 частота рака молочной железы и рака яичников значительно возрастает. Рак молочной железы, связанный с мутацией в гене BRCA1 характеризуется более ранним началом, более агрессивным протеканием заболевания и более высоким риском рецидива [3, 4].

Изучение биохимических механизмов и факторов окружающей среды, влияющих на возникновение и развитие онкопатологий приобретает все большую актуальность. Большое число исследований последнего времени направлены на выявление генетических полиморфизмов, способствующих развитию и возникновению злокачественных новообразований. Среди них особый интерес представляют полиморфизмы генов онкосупрессоров.

Цель работы заключается в изучении распределения частот аллелей и генотипов по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в популяционной выборке больных онкопатологией в Кабардино-Балкарии.

Для проведения настоящего исследования был проведен сбор образцов крови жительниц Кабардино-Балкарской Республики, больных раком молочной железы. Сбор осуществлялся среди пациенток, находившихся на лечении в ГБУЗ «Онкологический диспансер» МЗ КБР. Данные о каждом участнике эксперимента были собраны путем анкетирования. Анкетирование предусматривало регистрацию возраста, этнической принадлежности, возраста манифестации, наличия в семье онкопатологии, стадии заболевания, локализации и морфологических характеристик опухоли, возраста менархе, наличия детей, связи работы с вредными факторами среды, стажа курения или его отсутствие.

Лабораторные исследования были выполнены на базе Медико-биологического центра КБГУ.

Генотипирование проводилось методом аллель-специфичной ПЦР с помощью диагностического набора для выявления полиморфизмов в геноме человека методом ПЦР «SNP-экспресс» 185delAG в гене BRCA1 (мутация 1 BRCA1 185delAG) с последующей электрофоретической детекцией продуктов (производитель «Литех», Россия).

Было проведено исследование полиморфизма 185delAG гена BRCA1 у 130 неродственных индивидов больных раком молочной железы, в возрасте от 24 до 79 лет, проживающих на территории Кабардино-Балкарской Республики.

В результате генотипирования образцов ДНК были выявлены все три возможных генотипа данного гена (Ins/Ins, Ins/Del и Del/Del).

Результаты генотипирования полиморфизма 185delAG гена BRCA1 в общей выборке представлены в таблицах 1 и 2.

Таблица 1. Распределение частот генотипов по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в общей выборке

Генотипы

Общая выборка N = 130 человек

Количество человек

Частота, %

insAG/insAG

79

60,8

insAG/delAG

39

30

delAG/delAG

12

9,2

Таблица 2. Распределение частот аллелей по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в общей выборке

Аллели

Общая выборка N = 130 человек

Количество аллелей

Частота, %

insAG

197

75,77

delAG

63

24,23

Наблюдаемое распределение частот генотипов по исследованному локусу гена BRCA1 в общей выборке соответствует теоретически ожидаемому равновесному распределению Харди-Вайнберга (χ 2 = 1,648, p>0,05).

Для определения закономерностей, характерных для разных этнических групп, общая выборка была разделена по этнической принадлежности. В общей выборке (130 человек) были выявлены 7 этнических групп: кабардинцы, русские, балкарцы, осетины, татары, казахи и иорданцы.

Для анализа полиморфизма 185delAG гена BRCA1 были выбраны 2 этнические группы — русские и кабардинцы — как наиболее репрезентативные.

Результаты генотипирования полиморфизма 185delAG гена BRCA1 в двух выборках по этнической принадлежности представлены в таблицах 3-6.

Таблица 3. Распределение частот генотипов по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в этнической группе кабардинцев

Генотипы

Кабардинцы N = 53 человек

Количество человек

Частота, %

insAG/insAG

34

64,2

insAG/delAG

15

28,3

delAG/delAG

4

7,5

Таблица 4. Распределение частот аллелей по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в этнической группе кабардинцев

Аллели

Кабардинцы N = 53 человек

Количество аллелей

Частота, %

insAG

83

78,3

delAG

23

21,7

Наблюдаемое распределение частот генотипов по исследованному локусу гена BRCA1 в этнической группе кабардинцев соответствует теоретически ожидаемому равновесному распределению Харди-Вайнберга (χ2 = 0,476, p>0,05).

Таблица 5. Распределение частот генотипов по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в этнической группе русских

Генотипы

Русские N = 51 человек

Количество человек

Частота, %

insAG/insAG

33

64,7

insAG/delAG

15

29,4

delAG/delAG

3

5,9

Таблица 6. Распределение частот аллелей по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в этнической группе русских

Аллели

Русские N = 51 человек

Количество аллелей

Частота, %

insAG

81

77,9

delAG

21

22,1

Был проведен сравнительный анализ распределения частот генотипов по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в двух выборках по этнической принадлежности (таблица 7). Различия между популяционными выборками кабардинцев и русских по распределению частот генотипов не являются статистически достоверными (χ 2= 0,119 p = 0,943).

Таблица 7. Распределение частот генотипов по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в двух выборках больных РМЖ по этнической принадлежности

Генотипы

Кабардинцы N = 53

Русские N = 51

Значения χ 2, p

Количество человек

Частота, %

Количество человек

Частота, %

insAG/insAG

34

64,2

33

64,7

χ2 = 0,119

p = 0,943

insAG/delAG

15

28,3

15

29,4

delAG/delAG

4

7,5

3

5,9

Полученные результаты были сравнены с литературными данными. Данные распределения частот аллелей в исследуемой популяции близки к данным в популяциях Малой Азии и Восточной Европы и отличаются от данных популяции Юго-Западной Азии, Южной Америки и Западной Европы.

Был проведен сравнительный анализ распределения частот аллелей по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в двух выборках по этнической принадлежности (таблица 8). Различия между популяционными выборками кабардинцев и русских по распределению частот аллелей не являются статистически достоверными (χ 2= 0,038 p = 0,845).

Таблица 8. Распределение частот аллелей по полиморфизму 185delAG гена BRCA1 в двух выборках больных РМЖ по этнической принадлежности

Аллели

Кабардинцы N = 53

Русские N = 51

Значения χ 2, p

Количество аллелей

Частота, %

Количество аллелей

Частота, %

insAG

83

78,3

81

77,9

χ 2= 0,038

p = 0,845

delAG

23

21,7

21

22,1

Выводы

  1. Анализ генотипов в общей выборке больных РМЖ выявил встречаемость гомозиготных генотипов insAG/insAG, delAG/delAG с частотами 60,8% и 9,2%, соответственно. Уровень гетерозиготности составляет 30,0%. Доля аллелей insAG и delAG составляет 75,77% и 24,23%, соответственно;
  2. В кабардинской этнической группе больных РМЖ мутантный генотип delAG/delAG выявлен с частотой 7,5%. Мутантный аллель delAG представлен с частотой 21,7%;
  3. В этнической группе русских мутантный генотип delAG/delAG выявлен с частотой 5,9%. Мутантный аллель delAG представлен с частотой 22,1%;
  4. Сравнительный анализ распределения частот генотипов и аллелей в двух выборках по этническому признаку не выявил статистически достоверных различий между этническими группами;
  5. Полученные данные распределения частот аллелей в исследуемой популяции больных РМЖ близки к данным в популяциях Малой Азии и Восточной Европы и отличаются от данных популяции Юго-Западной Азии, Южной Америки и Западной Европы.

Читайте также

Список литературы

  1. Fuss J. O., Cooper P. K. DNA repair: dynamic defenders against cancer and aging. PLoS Biology. 2006; 4. p.203.
  2. Stark J. M., Pierce A. J., Oh J., Pastink A., Jasin M. Genetic steps of mammalian homologous repair with distinct mutagenic consequences. Molecular and Cellular Biology. 2004; 24. P.9305–9316.
  3. Bray F., Ferlay J., Soerjomataram I., Siegel R. L., Torre L. A., Jemal A. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA: А Cancer Journal for Clinicians. 2018; 68. P. 394–424.
  4. Larsen M. J., Thomassen M., Gerdes A.-M., Kruse T. A. Hereditary breast cancer: clinical, pathological and molecular characteristics. Breast Cancer. 2014; 8. P. 145-155.

Цитировать

Жарашуева, Д.В. Анализ полиморфизма 185delAG гена BRCA1 у больных онкопатологией в Кабардино-Балкарии / Д.В. Жарашуева. — Текст : электронный // NovaInfo, 2022. — № 132. — С. 11-13. — URL: https://novainfo.ru/article/19284 (дата обращения: 30.06.2022).

Поделиться